PVE玩法对阵容搭配的要求极高，合理的阵容组合能大幅提升通关效率。目前公认的PVE最强阵容主要有两套方案：第一套为阿龙+撒谎布+福克斯+奈美+塔希米+Mr.2，主战角色选择阿龙、撒谎布和福克斯，助战角色为奈美、塔希米和Mr.2。这套阵容兼顾攻击与防御，同时包含三种属性，可针对不同敌人进行克制，属于万金油组合，尤其适合新手玩家。第二套为路飞+佐罗+奈美+罗宾+烟鬼+巴奇，主战角色为路飞、佐罗和奈美，助战角色为罗宾、烟鬼和巴奇。该阵容同样包含力、技、心三种属性，路飞负责近战，佐罗提供控制，奈美远程输出，适合快速通关副本。
PVE模式中，角色强度直接影响战斗表现。艾尼路凭借大范围伤害和持续输出能力，成为PVE副本的首选角色。老沙作为兼具输出与防御的肉盾，前期直线伤害突出，后期可转型为全肉防御。艾斯则以高输出AOE技能著称，清图效率极高，优先级甚至高于其他SS伙伴。鹰眼在PVE中表现优异，技能兼具近程输出、远程输出、控制与突进能力，伤害极为爆表。这些角色在PVE中的表现已得到广泛验证，培养时可优先考虑。
阵容搭配需注重属性克制与职业分工。力属性角色如阿龙和路飞适合近战抗伤，技属性角色如佐罗和艾斯擅长控制与爆发，心属性角色如奈美和罗宾则提供远程输出与辅助。属性克制能显著提升伤害效率，例如力属性克制技属性，技属性克制心属性，心属性克制力属性。职业分工方面，近战角色需承担前排压力，控制角色需打断敌人技能，远程角色则需保持安全距离持续输出。合理的分工能最大化团队战斗力。
面对高难度关卡时，可优先选择具备霸体技能的角色，如索隆或烟鬼，以抵抗敌人控制。对抗群体敌人时，需搭配聚怪技能角色，如罗宾或鳄鱼助战，集中敌人后利用AOE技能快速清场。BOSS战中，破盾是关键，建议携带高爆发角色如艾斯或赤犬，破盾后衔接奥义技能打出致命伤害。海军元帅赤犬在PVE中表现尤为突出，其组合技能可减少技能CD，实现无限火力循环，适合持久战。
平民玩家可优先培养女帝、大熊和艾尼路，这些角色在PVE中性价比极高。资源有限时，建议集中升级主力角色的战意卡与激斗卡，紫色战意卡易获取且效果稳定，适合过渡使用。橙核心应优先用于升级核心输出的战意卡，如艾斯或鹰眼。每日任务与副本奖励是资源的主要来源，需按时完成以确保角色成长速度。
